1、处理发霉鞋子的基本方法是清洁和灭菌，严重者则水洗刷净，霉根如果深入皮层就要做染色处理。
2、零星发霉处理：如果鞋子发霉程度较轻，只有零星的霉菌，可以用软布蘸酒精加水将发霉的地方进行擦拭，然后再刷洗一下，再放到通风处晾干即可。
3、也可以使用碱性的肥皂水清洗发霉的鞋子，然后放在通风处晾干，切记暴晒，建议用一张餐巾纸或者卫生纸包住来晒。将水蜡摇晃均匀后倒一些在布或卫生纸上（不需要太多），直接在鞋子长霉菌的位置擦拭。
4、如果是白鞋子发霉了，一定要注意先不要着急刷洗，因为先刷洗很有可能留下黄斑。可以用少量的白醋加入水中浸泡鞋子（不能进水的除外）半个小时，然后再轻轻地刷洗掉，最后再包上白纸晾晒。
5、若您的鞋子发霉特别严重，长出了黑斑，你要么扔掉，要么切记不要自行处理，最好交由专业的皮件处理店家清洁，因为简单的清洁方式已无法处理霉斑。另外，要注意发霉的鞋子不要与其他鞋子或者皮件接触，以免霉菌扩大滋生。